公司培训协议在 符合法律规定的情况下是合法的。具体依据如下：
《劳动合同法》第二十二条：
用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与该劳动者订立协议，约定服务期。劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用。
培训费用与工资、奖金等分开计算：
培训费用与工资、奖金等是分开计算的，不存在将工资、奖金等计入培训费用的情况。
培训内容需合理合法：
培训内容需合理合法并有助于提升员工技能，公司确实为此付出了成本，并对此有所约定。
签订流程合法：
公司培训合同是否合法，要看合同签订流程是否符合法律规定，合同内容有无与法规相悖的条例等，以及合同中有没有产生金钱交易等。
综上所述，只要公司培训协议满足上述条件，即符合法律法规的规定、培训内容合理合法、培训费用明确、签订流程合法，并且双方自愿签订，那么该培训协议就是合法有效的。