日本人在二战期间不敢得罪约翰·拉贝的原因主要有以下几点：
盟国关系：
拉贝作为德国人，在二战期间是西门子公司驻中国商务代表，而德国与日本在二战期间是盟友。两国之间存在政治和军事上的联盟关系，因此日本人不敢轻易与德国人交恶，以免破坏大局，引发外交风波。
拉贝的身份和影响力：
拉贝不仅是德国人，还是纳粹党员。尽管纳粹政权与日本军部有相似之处，但拉贝在二战期间为中国难民提供了大量帮助，尤其是他在南京设立的安全区，拯救了约30万中国平民。这种人道主义行为赢得了国际社会的广泛赞誉，也使得日本不敢对他采取过激行动。
国际舆论和外交压力：
拉贝的行为得到了国际社会的广泛认可和支持，包括一些国际组织和外国政府。如果日本对拉贝采取不利行动，可能会引发国际舆论的谴责和对日本的外交压力，这对日本来说是一个巨大的风险。
战略考虑：
在二战期间，日本为了获取东南亚的战略物资，不得不对美英法宣战。在这种情况下，日本需要保持与西方国家的某种平衡，以免过度激化矛盾，影响其在亚洲的战略布局。
综上所述，日本人在二战期间不敢得罪拉贝，主要是因为拉贝的盟国身份、他在中国的特殊贡献以及国际舆论和外交压力等多重因素的共同作用。