惠州小学英语主要使用的教材版本是 人教版PEP英语教材。具体来说，惠州小学生一般从三年级开始学习英语，使用的教材是人民教育出版社的PEP版英语教材。尽管存在其他版本的英语教材作为辅助，但人教版PEP英语教材是主要的教材。此外，也有信息提到惠州小学三年级起点教材是PEP版，而一二年级的英语课可能不强调写，只注重听和说，教材可能由各个学校自行选择。
综上所述，可以确定惠州小学目前使用的英语教材版本是人教版PEP英语教材。