南京和苏州都是江苏省内的重要城市，且各自拥有不同的特色和优势。选择哪个城市的大专院校更好，取决于您的个人情况和偏好。以下是几个考虑因素：
专业与就业
苏州拥有新加坡工业园区和新区两个电子工业园，对于电子、机械等专业可能更有优势。
南京作为老牌专科院校，信息类专业可能更具优势。
城市环境与教育资源
苏州的环境相对干净，工业发达，教育资源虽不如南京丰富，但近年来引入了多所名校的分校。
南京作为全国高等教育第三城，教育资源丰富，基础教育较强。
生活成本
苏州的房价可能较高，工作机会虽多，但生活成本可能相应增加。
南京的生活成本和房价可能相对较低，但工作机会可能不如苏州丰富。
个人偏好
如果您更看重专业发展与就业前景，苏州可能更适合。
如果您更看重教育资源与学术氛围，南京可能更适合。
综上所述，建议您根据自己的专业兴趣、职业规划以及对生活环境的期望，综合考虑以上因素，做出适合自己的选择。