在牟平区，有几所大专学校，包括：
山东中医药高等专科学校牟平校区
地址：山东省烟台市牟平区滨海东路508号
简介：这是一所省属全日制普通高等专科学校，前身是始建于1958年的原山东省中医药学校，2004年改建为山东中医药高等专科学校。
山东医药高等专科学校养马岛校区
简介：位于山东省烟台市牟平区养马岛，该岛有“东方夏威夷”之称，环境优美，气候宜人。
烟台市牟平区职业中等专业学校
简介：这所学校是烟台市直属的国家级重点中等职业学校，提供中等职业教育。
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