新疆奎屯市拥有的大专院校包括：
新疆石河子职业技术学院
设有多个专业，如农业、工程、财经、外语等。
教学质量较高。
新疆农业大学科技学院
提供丰富的专业选择，如农业科学、工程、经济管理等。
奎屯市开放大学
专门针对成人教育的大学。
负责疆内外任何学校的成人教育考试管理。
新疆应用职业技术学院
公办全日制普通高等职业院校。
专注于培养应用型、技能型人才。
伊犁师范大学
隶属新疆维吾尔自治区教育厅管理的普通高等师范学校。
前身为1948年成立的新疆省立伊犁专科学校，后升格为普通本科院校，最终更名为伊犁师范大学。
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