卢梭关于自然教育的方法原则主要包括以下几点：
教育归于三个来源：
自然、人和事物。这三方面的教育是相互联系的，共同构成一个人的教育。自然的教育是自动发生的，我们无法控制；事物的教育部分可以控制，但主要还是要顺应自然；人的教育是我们能够真正控制的。
教育要服从自然的永恒法则：
教育必须遵循自然的法则，适应儿童天性的发展，促进其身心自然成长。卢梭将自然称之为“原始的倾向”。
遵循人的身心自由发展：
教育应尊重儿童的自然发展过程，不应强制或压抑其天性和欲望。他强调通过感官的感受去获得知识，并认为教育的最高目标是培养自由人。
顺应自然的次序：
儿童的发展应遵循自然的顺序，父母应配合儿童的自然成长，而不是强迫其按照成人的标准发展。
有节制的自由：
在教育中，自由是有限度的，应当限制那些背离自然需要的欲望，让孩子学会按照自己的能力调节欲望，避免染上坏习惯。
培养“自然人”：
卢梭认为教育的最终目标是培养“自然人”，即独立自主、自由平等、无所不能的人，而不是培养公民。自然人不受社会等级和身份的限制，能够自主实现自己的价值。
反对传统教育方式：
卢梭批判了当时流行的传统教育方式，如讲道理、发脾气和刻意感动，认为这些方法无法真正促进儿童的自然发展，主张引导个体实现自主成长。
这些原则共同构成了卢梭自然教育理论的核心，强调教育应顺应儿童的自然发展，尊重其天性和自由，避免人为的强制和干预。