选择电气自动化专业的专科院校时，可以考虑以下几个因素：
师资力量和教学资源：
选择有较强师资力量和优质教学资源的学校，如北京信息科技大学、上海电力学院等。
专业特色与合作：
考虑学校的专业特色，如电力系统背景，以及与电力企业的合作情况，如中国电力职业技术学院。
实习和就业机会：
选择提供良好实习和就业机会的学校，如青岛造价之家、淄博职业学院等。
就业率和声誉：
考虑学校的毕业生就业率和行业内的声誉，如南京机电职业技术学院、浙江机电职业技术学院等。
地理位置：
根据个人居住地的地理位置选择学校，以便于实习和就业。
学校历史和发展：
考虑学校的历史沿革和未来发展，如南京工程学院由南京电力专科学校发展而来。
综合排名：
参考学校在不同排名中的位置，如华北水利水电大学、北京工业职业技术学院等。
请根据以上因素，结合个人兴趣和职业规划，选择最适合自己的电气自动化专业专科院校。