番禺区共有17所大学，其中包括本科院校和专科院校。以下是部分番禺区的院校列表：
本科院校：
中山大学
华南理工大学
华南师范大学
广州大学
广东外语外贸大学
广州中医药大学
广东药科大学
广东工业大学
广州美术学院
星海音乐学院
暨南大学
广州医科大学
专科院校：
番禺职业技术学院
广东工业大学番禺校区
广东女子职业技术学院
广东文艺职业学院
广州科技贸易职业学院
广东轻工职业技术学院
广东交通职业技术学院
广东水利电力职业技术学院
民办南华工商学院
私立华联学院
广州民航职业技术学院
广东农工商职业技术学院
广东科学技术职业学院
广东食品药品职业学院
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