五指山市拥有多所大专学校，其中包括：
海南民族师范学校：
成立于2006年4月，是一所公立大专学校。
海南省第二卫生学校：
创办于1958年，隶属于海南省卫生健康委员会，是海南省办学历史最久的卫生学校。
琼州学院：
学校属性为省属全日制公办本科院校，五指山校区是琼州学院组成部分，主要从事专科教育。琼州学院的前身可追溯到1954年创办的海南黎族苗族自治区师范学校和1958年创办的海南黎族苗族自治州师范专科学校，后经过发展，于2006年升格为本科院校，并更名为琼州学院。
海南热带海洋学院五指山校区：
这是一所高等职业技术学院，以培养应用型人才为主，开设有旅游管理、酒店管理、烹饪技术与管理、电子商务、计算机应用技术、动漫设计与制作、艺术设计等专业。
五指山市中等职业学校：
创建于1988年，是五指山市最早成立的中等职业学校之一，专业包括机械制造、计算机应用等，注重实践能力和创新精神培养。
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