肇庆市农业学校提供全日制大专教育。该校在1958至1963年和1975至1981年期间曾开办过大专层次教育，并在1999年被评定为省级重点中专学校，2005年进一步被评定为“国家级重点中等职业学校”。自2019年起，经广东省教育厅批准，肇庆市农业学校与省属公办高职院校合作，设立高职专业学院，招收全日制大专班，毕业时颁发相应高职院校全日制毕业证书，并享受普通高校毕业生待遇。
肇庆市农业学校的大专教育专业设置广泛，包括农业科技、农艺技术、农业管理以及农村经济等方面的学习内容。学校还与广东工贸职业技术学院等高职院校联合办学，开设了数字媒体应用技术、新能源汽车技术、学前教育等专业