潼南区目前拥有一所专科大学，即重庆电力高等专科学校。这所学校是西南地区唯一的电力类高等专科学校，提供多种专科专业，涵盖工程技术、管理、经济、艺术等多个领域。学校位于潼南区金福新区北部，背靠九龙山带状森林公园，面临城市新区。
重庆电力高等专科学校的历史可以追溯到1953年成立的重庆电气工业学校，经过多次更名和发展，现已成为一所以工科为主，多学科协调发展的全日制普通本科院校。学校设有电力工程学院、电气工程学院、动力工程学院、智能工程学院、经济管理学院、信息工程学院等6个二级学院，并开设了31个专业。
此外，潼南区还有其他一些高等教育机构，如重庆艺术工程职业学院、重庆师范大学涉外商贸学院、西南大学育才学院、重庆青年职业技术学院、重庆对外经贸学院、重庆工商职业学院、重庆移通学院等。