《大学问》这首歌不太可能成为林夕老师的黑历史。以下是一些原因：
歌曲主题积极正面：
《大学问》这首歌的歌词直白，鼓励大学生继续学习，不因学业结束而终止探究。这是一种对后辈的期盼，且符合社会主流价值观。
林夕的创作风格：
林夕本人在工作以后仍然保持高度的学习和输入，大量阅读，才有歌词源源不断的灵感。他自嘲为“知道分子”，并且讨厌虚伪励志，总是辩证地、从独特的角度看待事物。这种创作风格和态度使得他的作品具有独特的价值和深度。
歌曲在重要场合被演唱：
2016年6月30日，汕头大学2016届毕业典礼上，师生现场合唱《大学问》。这首歌在如此重要的场合被演唱，说明它在当时具有很高的认可度和影响力。
综上所述，《大学问》这首歌不仅主题积极正面，而且符合林夕的创作风格，并在重要场合得到了广泛认可。因此，它不太可能成为林夕老师的黑历史。